Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIB5

Barhl2, BarH-like 2 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl2Q8VIB5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Barhl2Q8VIB5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Barhl2Q8VIB5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Barhl2Q8VIB5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Barhl2Q8VIB5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Barhl2Q8VIB5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barhl2Q8VIB5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Barhl2Q8VIB5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barhl2Q8VIB5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Barhl2Q8VIB5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms