Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ4

Nle1, Notchless protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nle1Q8VEJ4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nle1Q8VEJ4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nle1Q8VEJ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nle1Q8VEJ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms