Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d2Q8VD57 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d2Q8VD57 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d2Q8VD57 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms