Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup35Q8R4R6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup35Q8R4R6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup35Q8R4R6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup35Q8R4R6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms