Protein–RNA interactions for Protein: Q8R480

Nup85, Nuclear pore complex protein Nup85, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup85Q8R480 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup85Q8R480 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup85Q8R480 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup85Q8R480 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup85Q8R480 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup85Q8R480 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup85Q8R480 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup85Q8R480 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nup85Q8R480 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup85Q8R480 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup85Q8R480 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms