Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps37cQ8R105 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vps37cQ8R105 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vps37cQ8R105 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vps37cQ8R105 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vps37cQ8R105 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37cQ8R105 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37cQ8R105 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vps37cQ8R105 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms