Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolbQ8K409 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PolbQ8K409 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PolbQ8K409 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolbQ8K409 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms