Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r188Q8K3N2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r188Q8K3N2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r188Q8K3N2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms