Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fcho1Q8K285 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcho1Q8K285 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcho1Q8K285 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcho1Q8K285 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcho1Q8K285 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcho1Q8K285 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fcho1Q8K285 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcho1Q8K285 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fcho1Q8K285 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fcho1Q8K285 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms