Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rp1l1Q8CGM2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rp1l1Q8CGM2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rp1l1Q8CGM2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rp1l1Q8CGM2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rp1l1Q8CGM2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms