Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gpc3Q8CFZ4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpc3Q8CFZ4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpc3Q8CFZ4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gpc3Q8CFZ4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gpc3Q8CFZ4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms