Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc63Q8CDV6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc63Q8CDV6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc63Q8CDV6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.4 ms