Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc73Q8CDM4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc73Q8CDM4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc73Q8CDM4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc73Q8CDM4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc73Q8CDM4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc73Q8CDM4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc73Q8CDM4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc73Q8CDM4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc73Q8CDM4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc73Q8CDM4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc73Q8CDM4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms