Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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