Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrn3Q8CBC6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrn3Q8CBC6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn3Q8CBC6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn3Q8CBC6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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