Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrp11Q8CB67 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrp11Q8CB67 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp11Q8CB67 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp11Q8CB67 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms