Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnot2Q8C5L3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnot2Q8C5L3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot2Q8C5L3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot2Q8C5L3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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