Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8C5C9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8C5C9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q8C5C9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q8C5C9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8C5C9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C5C9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8C5C9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8C5C9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8C5C9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8C5C9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C5C9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8C5C9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8C5C9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8C5C9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C5C9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8C5C9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms