Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4H2

Samd3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd3Q8C4H2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd3Q8C4H2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samd3Q8C4H2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd3Q8C4H2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd3Q8C4H2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms