Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx22Q8C084 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx22Q8C084 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx22Q8C084 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms