Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snx16Q8C080 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx16Q8C080 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx16Q8C080 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms