Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rdh12Q8BYK4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh12Q8BYK4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rdh12Q8BYK4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rdh12Q8BYK4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms