Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sall4Q8BX22 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall4Q8BX22 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sall4Q8BX22 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sall4Q8BX22 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms