Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmod1Q8BVA4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmod1Q8BVA4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lmod1Q8BVA4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmod1Q8BVA4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmod1Q8BVA4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms