Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppfia2Q8BSS9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppfia2Q8BSS9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfia2Q8BSS9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia2Q8BSS9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia2Q8BSS9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms