Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm10600Q8BQ57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm10600Q8BQ57 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm10600Q8BQ57 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms