Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14,91□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,91□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,91□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,9□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,9□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,9□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14,9□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14,9□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC14,9□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,9□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,9□□□□□ -0,02
5730596B20RikQ8BQ08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,89□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14,88□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,86□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC14,86□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,86□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14,86□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,86□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,85□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC14,85□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC14,85□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14,84□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14,83□□□□□ -0,03
5730596B20RikQ8BQ08 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC14,83□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14,83□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14,83□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14,79□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,79□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14,79□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,79□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,79□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14,78□□□□□ -0,04
5730596B20RikQ8BQ08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,6 ms