Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zcchc4Q8BKW4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc4Q8BKW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc4Q8BKW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms