Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gcfc2Q8BKT3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gcfc2Q8BKT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gcfc2Q8BKT3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gcfc2Q8BKT3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms