Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dupd1Q8BK84 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dupd1Q8BK84 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dupd1Q8BK84 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms