Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rufy1Q8BIJ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy1Q8BIJ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy1Q8BIJ7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rufy1Q8BIJ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms