Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ9

Slu7, Pre-mRNA-splicing factor SLU7, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slu7Q8BHJ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slu7Q8BHJ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slu7Q8BHJ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Slu7Q8BHJ9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slu7Q8BHJ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms