Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frmd3Q8BHD4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Frmd3Q8BHD4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmd3Q8BHD4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmd3Q8BHD4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms