Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Htatsf1Q8BGC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Htatsf1Q8BGC0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Htatsf1Q8BGC0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms