Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NfascQ810U3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NfascQ810U3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfascQ810U3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NfascQ810U3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms