Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Liat1Q810M6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Liat1Q810M6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Liat1Q810M6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Liat1Q810M6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Liat1Q810M6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms