Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChfrQ810L3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChfrQ810L3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChfrQ810L3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChfrQ810L3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms