Protein–RNA interactions for Protein: Q80V94

Ap4e1, AP-4 complex subunit epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4e1Q80V94 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap4e1Q80V94 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap4e1Q80V94 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap4e1Q80V94 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap4e1Q80V94 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms