Protein–RNA interactions for Protein: Q80UV9

Taf1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1Q80UV9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf1Q80UV9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1Q80UV9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf1Q80UV9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Taf1Q80UV9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1Q80UV9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1Q80UV9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1Q80UV9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1Q80UV9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1Q80UV9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1Q80UV9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1Q80UV9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1Q80UV9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms