Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rab3gap1Q80UJ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rab3gap1Q80UJ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab3gap1Q80UJ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms