Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ctdp1Q7TSG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctdp1Q7TSG2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdp1Q7TSG2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctdp1Q7TSG2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctdp1Q7TSG2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms