Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf18Q7TS55 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfsf18Q7TS55 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfsf18Q7TS55 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms