Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LnpkQ7TQ95 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LnpkQ7TQ95 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LnpkQ7TQ95 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LnpkQ7TQ95 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms