Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Smap2Q7TN29 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smap2Q7TN29 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smap2Q7TN29 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms