Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Rtl1Q7M732 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Rtl1Q7M732 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rtl1Q7M732 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Rtl1Q7M732 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Rtl1Q7M732 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rtl1Q7M732 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Rtl1Q7M732 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Rtl1Q7M732 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Rtl1Q7M732 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Rtl1Q7M732 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Rtl1Q7M732 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Rtl1Q7M732 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rtl1Q7M732 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Rtl1Q7M732 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms