Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sys1Q78S06 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sys1Q78S06 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sys1Q78S06 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sys1Q78S06 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms