Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Higd1cQ76I25 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Higd1cQ76I25 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Higd1cQ76I25 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms