Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2d2bQ6ZWY6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2d2bQ6ZWY6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms