Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQL4

Wdr43, WD repeat-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr43Q6ZQL4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Wdr43Q6ZQL4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Wdr43Q6ZQL4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Wdr43Q6ZQL4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Wdr43Q6ZQL4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr43Q6ZQL4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdr43Q6ZQL4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr43Q6ZQL4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr43Q6ZQL4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms