Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnt1Q6ZPR4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnt1Q6ZPR4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kcnt1Q6ZPR4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kcnt1Q6ZPR4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms